Jusqu’à quatre joueurs peuvent se connecter en ligne ou en local pour accomplir des missions en coopération dans cette aventure de science-fiction en vue subjective se déroulantdans l’univers de Metroid Prime. Les joueurs revêtent une mech suit et travaillent en équipe pour nettoyer des bases infestées d’ennemis et accomplir leurs objectifs de mission. Une fois que les missions ont été accomplies,jusqu’à six joueurs peuvent s’affronter dans Metroid Prime: Blast Ball, un jeu à trois contre trois où les joueurs doivent marquer avec un ballon dans le but de adverse. Le jeu sera disponible en 2016.